CGM - Département Dynamique et Stabilité des Génomes
Réarrangements programmés du génome - Mécanismes et régulation
Responsable : Mireille BÉTERMIER
MàJ : 05/10/11
L'équipe
Mireille Bétermier, Directeur de Recherche, CNRS
Julien Bischerour, Chargé de Recherche, CNRS
Emeline Dubois, chercheur post-doctorant
Antoine Marmignon, Doctorant allocataire
Nathalie Mathy, Assistant Ingénieur
Vinciane Régnier, Maître de Conférences, Univ. Paris-Diderot
Notre adresse
CNRS - Centre de Génétique Moléculaire
Avenue de la Terrasse - Bât. 26
91198 GIF-SUR-YVETTE Cedex
FRANCE
Téléphone : 33 (0)1 69 82 31 64
Fax : 33 (0)1 69 82 31 81
Thématique de recherche
Nous étudions les mécanismes moléculaires impliqués dans les réarrangements de l’ADN survenant de façon programmée au cours du développement chez le cilié modèle Paramecium tetraurelia. Les résultats récents du laboratoire indiquent que des milliers de courtes séquences germinales, les IES (Internal Eliminated Sequences), sont excisées précisément des phases ouvertes de lecture ainsi que d’autres régions – non codantes – du génome, dans une fenêtre de temps bien définie pendant l’assemblage du génome somatique. Nous avons également montré que des cassures double-brin sont introduites aux bornes des IES lors de l’étape d’initiation de l’excision.
Notre équipe s’est installée au CGM en mars 2006, avec le soutien financier du CNRS (programme ATIP en Génétique). Nos travaux en cours visent à identifier les partenaires protéiques intervenant dans la réaction d’excision des IES, à l’aide d’approches moléculaires, cellulaires et génomiques. Depuis l'automne 2006, nous bénéficions également d'un financement FRM.
Choix de publications
- Kapusta, A., Matsuda, A., Marmignon, A., Ku, M., Silve, A., Meyer, E., Forney, JD., Malinsky, S., Bétermier, M. (2011) Highly Precise and Developmentally Programmed Genome Assembly in Paramecium Requires Ligase IV-Dependent End Joining. PLoS Genet, 7 (4) :e1002049.
- Nowak, J. K., Gromadka, R., Juszczuk, M., Jerka-Dziadosz, M., Maliszewska, K., Mucchielli, M. H., Gout, J. F., Arnaiz, O., Agier, N., Tang, T., Aggerbeck, L. P., Cohen, J., Delacroix, H., Sperling, L., Herbert, C. J., Zagulski, M., Betermier, M. (2011) A functional study of genes essential for autogamy and nuclear reorganization in Paramecium. Eukaryot Cell, 10 (3) 363-72.
- Bouhouche, K., Gout, J-F., Kapusta, A., Bétermier, M., Meyer, E. (2011) Functional specialization of Piwi proteins in Paramecium tetraurelia from post-transcriptional gene silencing to genome remodelling. Nucleic Acids Res, 39 (10) 4249-4264.
- Arnaiz, O., Gout, J-F., Bétermier, M., Bouhouche, K., Cohen, J., Duret, L., Kapusta, A., Meyer, E. and Sperling, L. (2010) Gene expression in a paleopolyploid: a transcriptome resource for the ciliate Paramecium tetraurelia. BMC Genomics, 11:547.
- Beisson, J., Bétermier, M., Bré, M.-H., Cohen, J., Duharcourt , S., Duret, L., Kung, C., Malinsky, S., Meyer, E., Preer, J.-R. and Sperling, L. (2010) Paramecium tetraurelia: The Renaissance of an Early Unicellular Model. CSH Protoc, 2010 (1) pdb.emo140.
Complements to this publication may be found at the following URL: http://paramecium.cgm.cnrs-gif.fr/parawiki/Protocols
- Baudry, C., Malinsky, S., Restituito, M., Kapusta, A., Rosa, S., Meyer and E., Bétermier, M. (2009). PiggyMac, a domesticated piggyBac transposase involved in programmed genome rearrangements in the ciliate Paramecium tetraurelia. Genes & Dev, 23 (21) 2478-83.
- Lepère, G., Bétermier, M., Meyer, E. and Duharcourt, S. (2008) Maternal noncoding transcripts antagonize the targeting of DNA elimination by scanRNAs in Paramecium tetraurelia. Genes Dev, 22 (11) 1501-12.
- Gratias, A., Lepère, G., Garnier, O., Rosa, S., Duharcourt, S., Malinsky, S., Meyer, E. and Bétermier, M. (2008) Developmentally programmed DNA splicing in Paramecium reveals short-distance crosstalk between DNA cleavage sites. Nucleic Acids Res, 36 (10) 3244-51.
- Aury, J-M., Jaillon, O., Duret, L., Noel, B., Jubin, C., Porcel, BM., Ségurens, B., Daubin, V., Anthouard, V., Aiach, N., Arnaiz, O., Billaut, A., Beisson, J., Blanc, I., Bouhouche, K., Câmara, F., Duharcourt, S., Guigo, R., Gogendeau, D., Katinka, M., Keller, A-M., Kissmehl, R., Klotz, C., Koll, F., Le Mouël, A., Lepère, G., Malinsky, S., Nowacki, M., Nowak, J-K., Plattner, H., Poulain, J., Ruiz, F., Serrano, V., Zagulski, M., Dessen, P., Bétermier, M., Weissenbach, J., Scarpelli, C., Schächter, V., Sperling, L., Meyer, E., Cohen, J., & Wincker, P. (2006) Global trends of whole-genome duplications revealed by the ciliate Paramecium tetraurelia. Nature, 444(7116):171-178.
- Bétermier, M. (2004). Large-scale genome remodelling by the developmentally programmed elimination of germ line sequences in the ciliate Paramecium. Res. Microbiol. 155 : 399-408.
- Gratias, A., Bétermier, M. (2003). Processing of double-strand breaks is involved in the precise excision of Paramecium IESs. Mol. Cell. Biol. 23 : 7152-7162.
- Bétermier, M., Duharcourt, S., Seitz, H., Meyer, E. (2000) Timing of developmentally programmed excision and circularization of Paramecium internal eliminated sequences. Mol. Cell. Biol. 20 : 1553-1561.
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