L'équipe

Frédéric Boccard, Directeur de Recherche, CNRS

Camille Cibot, Doctorante

Stéphane Duigou, Chargé de Recherche CNRS

Pauline Dupaigne, Postdoctorante

Michèle Valens, Ingénieur de Recherche, CNRS

Isabelle Vallet-Gély, Chargé de Recherche, CNRS

Notre adresse

CNRS - Centre de Génétique Moléculaire - UPR 3404

Avenue de la Terrasse - Bât. 26

91198 GIF-SUR-YVETTE Cedex

FRANCE

Tél. : 33 (0)1 69 82 32 11

Fax : 33 (0)1 69 82 31 50

Thématique 1

Frédéric Boccard, Axel Thiel, Michèle Valens

Organisation du chromosome bactérien

Notre laboratoire s’intéresse aux mécanismes qui assurent la condensation et la ségrégation du chromosome de Escherichia coli au cours du cycle cellulaire.

L’étude génétique des interactions à distance chez le colibacille a démontré l’existence d’une organisation du chromosome en quatre macrodomaines et en deux régions non structurées. Les macrodomaines, grandes régions de l’ordre du mégabase, sont isolés les uns des autres indiquant l’existence de phénomènes de condensation et de localisation.

Notre projet vise à caractériser les mécanismes de structuration des macrodomaines et à comprendre leur rôle dans le contrôle du cycle cellulaire. L'analyse du comportement de marqueurs chromosomiques fluorescents pendant un cycle cellulaire complet a permis de montrer que la structuration en macrodomaines influence la ségrégation du chromosome et la dynamique de la molécule d’ADN. L’analyse de réarrangements chromosomiques permet d’identifier des facteurs qui limitent la plasticité de ce génome bactérien et de déterminer comment les macrodomaines sont impliqués dans la progression du cycle cellulaire.

L’identification des facteurs responsables de la structuration des macrodomaines nous permettra d'aborder l'étude des mécanismes qui assurent la condensation et la localisation subcellulaire des chromosomes.

Publications sélectionnées

Mercier, R., Petit, M.-A., Schbath, S., Robin, S., El Karoui, M., Boccard, F. and Espéli, O. (2008) The MatP/matS site-specific system organizes the terminus region of the E. coli chromosome into a macrodomain. Cell, 135 (3) 475-85.

Espeli, O. Mercier, R. and Boccard, F. (2008) DNA dynamics vary according to macrodomain topography in the E. coli chromosome.Mol Microbiol, 68 (6) 1418-27.

Esnault, E., Valens, M., Espéli, O. and Boccard, F. (2007) Chromosome Structuring Limits Genome Plasticity in Escherichia coli. PLoS Genet, 3 (12) e226.

Espeli, O. and Boccard, F. (2006) Organization of the Escherichia coli chromosome into macrodomains and its possible functional implications. J Struct Biol, 156 (2) 304-10.

Boccard, F., Esnault, E., and Valens, M. (2005). Spatial arrangement and macrodomain organization of bacterial chromosomes. Molecular Microbiology 57 , 9-16.

Moulin, L., Rahmouni, A. R., and Boccard, F. (2005). Topological insulators inhibit diffusion of transcription-induced positive supercoils in the chromosome of E. coli. Molecular Microbiology 55 , 601-610 .

Valens, M., Penaud, S., Rossignol, M., Cornet, F., and Boccard, F. (2004). Macrodomain organization of the E. coli chromosome. EMBO J 23(21):4330-41

Thématique 2

En collaboration avec l'équipe de Bruno Lemaitre

Interactions hôte-pathogène

Notre équipe étudie également les interactions hôte-pathogène en utilisant la drosophile comme hôte. Deux bactéries capables d’infecter la drosophile, Pseudomonas entomophila et Erwinia carotovora, ont été sélectionnées ; nos travaux visent la caractérisation des processus utilisés par ces bactéries pathogènes pour infecter la drosophile. Ces travaux sont réalisés en étroite collaboration avec l’équipe de Bruno Lemaitre.

Publications sélectionnées

Vallet-Gely, I., Opota, O., Boniface, A., Novikov, A., Lemaitre, B. (2010) A secondary metabolite acting as a signaling molecule controls Pseudomonas entomophila virulence. Cell Microbiol, 12 (11) 1666-79.

Vallet-Gely, I., Novikov, A., Augusto, L., Liehl, P., Bolbach, G., Péchy-Tarr, M., Cosson, P., Keel, C., Caroff, M., Lemaitre, B. (2010) Association of hemolytic activity of Pseudomonas entomophila, a versatile soil bacterium, with cyclic lipopeptide production. Appl Environ Microbiol, 76 (3) 910-21.

Quevillon-Cheruel, S., Leulliot, N., Acosta Muniz, C., Vincent, M., Gallay, J., Argentini, M., Cornu, D., Boccard, F., Lemaitre, B. and van Tilbeurgh, H. (2009) Evf, a virulence factor produced by the Drosophila pathogen Erwinia carotovora is a S-palmitoylated protein with a new fold that binds to lipid vesicles. J Biol Chem, 284 (6) 3552-3562.

Vallet-Gely, I., Lemaitre, B. and Boccard, F. (2008) Bacterial strategies to overcome insect defences. Nat Rev Microbiol, 6 (4) 302-13.

Acosta Muniz, C., Jaillard, D., Lemaitre, B. and Boccard, F. (2007) Erwinia carotovora Evf antagonizes the elimination of bacteria in the gut of Drosophila larvae. Cell Microbiol, 9 (1) 106-19.

Vodovar, N., Vallenet, D., Cruveiller, S., Rouy, Z., Barbe, V., Acosta, C., Cattolico, L., Jubin, C., Lajus, A., Segurens, B., Vacherie, B., Wincker, P., Weissenbach, J., Lemaitre, B., Médigue, C. and Boccard, F. (2006) The complete genome sequence of the entomopatogenic and metabolically versatile soil bacterium Pseudomonas entomophila Nature Biotech, 24 (6) 673-9.

Liehl, P., Blight, M., Vodovar, N., Boccard, F. and Lemaitre, B. (2006) Prevalence of local immune response against oral infection in a Drosophila/Pseudomonas infection model. PLoS Pathog, 2 (6) e56.

Vodovar, N., Vinals, M., Basset, A., Degrouard, J., Spelmann, P. T., Boccard, F., and Lemaitre, B. (2005). Drosophila host defense after oral infection by an entomopathogenic Pseudomonas species. Proc Natl Acad Sci USA 102, 11414-11419

Vodovar N, Acosta C, Lemaitre B, Boccard F. (2004) Drosophila: a polyvalent model to decipher host-pathogen interactions. Trends Microbiol. 12(5):235-42.

Toutes les publications des membres de l'équipe depuis 1996